Вероятно, лучше всего спрашивать о скрипте и запуске после обучения там, где он был найден. Либо на форумах, где обсуждаются Сиамские сети и Keras.
Тоже самое относится и к формату файлов. Вкратце, изображение в градациях серого используются для упрощения сравнений. Поэтому, прежде чем изображение будет обработано, его предстоит преобразовать. Конвертируете свой PNG на входе в нужный формат, и подаете уже подготовленное изображение в модель.
Можно воспользоваться также поиском google: www.google.ru/search?q=сиамская+сеть&oq=сиамская+сеть